DS5毒針で

仲間になるモンスターの息の根を止めて倒したら仲間にならないんですか？

なりますよ〜
ならないのはニフラム、ふうじんのたて等です

そうなんですかぁ…じゃあ頑張ります☆レベルは関係ないですよね？
なかなか仲間にならなくて99になってしまいましたが…

主人公のLv.が 99 なら、条件として問題は無いです
（｢高過ぎて仲間にならない｣)ということは無いので。