まったく失礼ではありませんよ。
色鉛筆も立派な彩色方法の一つです。
また、コピックとは歴史も比べ物になりませんし、しっかり一つのジャンルとしても成立しているものです。(むしろ出始めの頃はコピックの方が手抜き扱いされた位です)
彩色方法に貴賎は無いのですから、ご自分の表現されたいものに合うやり方で堂々と描かれて下さい。(色鉛筆は勿論、クレヨンだってコピックだってキリ絵や貼り絵だってどれも素敵な方法です)

水彩については私も年賀状で使いますが、一度に広い面積を塗らないことや水を多く含ませすぎなければそんなに曲がることはありません。
心配なら一枚試し塗りして、塗り方の加減を調節するといいですよ。