私は海水浴等ではすっぴんで行っています。
水に強いコスメとはいえ、もしメイクが崩れたら酷いでしょうし（現に、ロケの際パンダのようになりました
写真を撮るのではなければ、すっぴんで行く方がいいと思います。
やはり、真水と違って塩分や薬品、その他色々なものが混じっている水ですので。
どうしてもという場合は、目元だけメイクするのがいいかもしれません。
マスカラでいえば、マジョマジョがオススメです。
水が顔にかかると拭ってしまうので、（特に目元は）他の化粧はしない方が肌のためだと思います。
あとは、日焼け防止に定期的に日焼け止めクリーム等を塗るなどした方がいいかと。