もし私がゲストの立場でしたら無断で顔をいじられる(たとえ綺麗になるとしても)のは嫌ですね。

連絡が可能ならゲストに訊ねてみては如何でしょう？もし連絡が取れなくて、主さんがよっぽどホクロが気になるのでしたら消さずにホクロを薄く見えるよう加工する程度ならしても構わないと思います。